發酵小葉苦丁的危害有：加重風濕性關節炎或者是風寒的病情，導致月經不調，加重腸道疾病症狀。
發酵過後的小葉苦丁茶，雖然能夠對機體進行調整和改善，但是長期大量的飲用有可能會使寒濕氣排出受到影響，如果有類風濕性關節炎或者是風寒的情況，特別容易加重病情。
女士生理期處在失血過多情況，苦丁茶寒性，非常容易造成血氣鬱滯、月經難排，引起經痛，情況嚴重可導致月經不調。而有經痛身體素質的女士更應少喝。
剛剛生小寶寶的孕婦體質虛弱，苦丁茶不但不利生完孩子孑宮的修復，還會繼續傷着腸胃，非常容易引起今後的腹部冷痛。如果脾胃比較虛寒，喝了之後很有可能造成腹脹以及拉肚子的情況。
