三級警司和二級警員的區別在於銜級不同、警銜標誌不同、職務不同、授予機構不同、晉級期限不同。
1、銜級不同：“三級警司”是指中華人民共和國人民警察警銜當中的第11級(共五等十三級)，警銜是區分人民警察等級、表明人民警察身份的稱號和標誌，是國家給予人民警察的榮譽。“二級警員”為中國警銜體系的最低等級，即第13級。
2、警銜標誌不同：的警銜標誌由銀色橫槓和銀色四角星花組成，“三級警司”的警銜是一道銀色橫槓、一顆銀色四角星花。“二級警員”的標誌為1枚四角星花。
3、職務不同：科員（警長）職：三級警督至三級警司；辦事員（警員）職：一級警司至二級警員。二級警員是警銜中的最低級別，三級警司要比二級警員高出一個級別，三級警司可以授予科員、辦事員、專業技術初級等職位，二級警員只授予辦事員。
4、授予機構不同：警司由省、自治區、直轄市公安廳（局）廳（局）長批准授予；警員由省、自治區、直轄市公安廳（局）政治部主任批准授予。
5、晉級期限不同：二級警員至一級警司，每晉升一級為三年；一級警司至一級警督，每晉升一級為四年。在職的人民警察在院校培訓的時間，計算在警銜晉級的期限內。
