《進擊的巨人最終季 Part.2》講述了在艾倫他們居住的帕拉迪島之外，還存在一個其他人類居住的世界。當中一個國家瑪雷與其他各國爆發戰爭。陷入苦戰之際，他們決定要攻進帕拉迪島。
動畫劇情開篇就是大戰，在皮克挑明身份之後，艾倫化身進擊的巨人向來襲的馬萊開戰，萊納再次和艾倫肉搏，在車巨和顎巨的圍攻之下，艾倫即使擁有戰錘的力量，也只能勉強防禦，由於弗洛克和伊蕾娜的種種操作，調查兵團的最強兵力們全部被關押，在艾倫和帕拉迪島生死存亡之時，伊蕾娜為首的人全懵了，關鍵時刻還是歐良果鵬去補救，他去釋放了愛爾敏等人，並且説服了他們幫助艾倫對抗馬萊的圍攻。
