不管是用頭髮或DMSA激發測試，只要發現有中毒可能，就必須治療，最重要的當然是排除任何重金屬來源，若受到含鉛或汞的油漆污染，最好搬家或將含毒的油漆去除。
若孩子有咬衣服的習慣，就必須換掉含銻(防燃劑)的品牌，如果主要來源為疫苗，則以後施打時要注意避免。此外，最好少吃大型魚類，若不想飲用含高量鈾和砷的水，建議該用瓶裝蒸餾水。
接下來再以藥劑去除有毒金屬，最常用的是DMSA。DMSA可以檢測，也是治療處方，通常用來去除多種金屬，如鉛、汞、鎘、砷和銻，這個過程稱為[螯合]，需要時長達一至二年，年齡越小，所需治療時間愈短。
雖有一些副作用，但仍相當安全。為了保險起見，患者每週應做白血球與血小板數量評估。如果醫師採用的是較緩和的螯合療程，給的劑量較低，所花的時間較長，那就只要二至三個月做一次血液檢測即可。
此外，補充鈣、鎂、硒和鋅也非常重要，因為這些金屬在螯合過程中，會與毒性金屬競爭而消耗掉。有時也不妨添加一些能去除重金屬的營養補充劑，總之而言，治療重金屬中毒也和其他治療一樣，必須力求謹慎，而且最好請教經驗豐富的醫師。
