導致肛門撕裂發生的原因主要包括：便祕、不良的排便習慣、外傷、感染以及缺血等，另外還有一些患者是因為人體本身的原因造成的，在平時應注意預防。
1、人體本身因素
人體肛門外括約肌由尾骨向前到肛管後方，分為二部分，沿肛管兩側向前圍繞肛管，到肛管前方此二部連合，在肛管前方和後方留有間隙，肛提肌的大部分附着肛管兩側，前部和後部較少，肛管後部和前部不如兩側堅固，容易損傷，肛管向下向後成肛管直腸角，肛管後部受糞便壓力較大。肛管後正中線血供給缺乏，彈性較小，均能導致肛裂。
2、便祕
由於直腸內長期滯留宿便可誘發直腸癌，糞便堆積還影響血液循環。患者用力解出乾燥糞塊，必然會使肛門承受較大壓力，產生裂口、脹腫等一系列病理改變。所以肛裂患者在治療時，一定要根治便祕，以防出現肛裂反覆發作的現象。
3、排便習慣不當
排便時間長，容易造成肛門直腸內瘀血而誘發疾病。上廁時吸煙能緩衝大腦的排便反射，極容易造成便祕。排便時用力過猛，盲目不停地猛力努掙，只能使直腸肛門和盆底肌肉增加負擔與局部瘀血，導致肛裂的發生和發展。
4、外傷
慢性便祕患者，由於大便乾硬，排糞時用力過猛，易損傷肛管皮膚，反覆損傷使裂傷深及全層皮膚，形成慢性感染性潰瘍。有人報道，便祕致肛裂佔14%~24%，但是便祕也可能是肛裂的後果，是由於病人懼怕排便所致。此外，產傷也可致肛裂，約佔3%~9%。腹瀉時頻繁排便，肛管敏感緊縮也易損傷，反覆損傷形成慢性感染性潰瘍。
5、感染
齒狀線附近的慢性炎症，如後正中處的肛竇炎，向下蔓延而致皮下膿腫，破潰而成為慢性潰瘍;肛管損傷後亦難癒合的原因至今不明，有人認為主要是損傷合併感染所致，感染時炎性細胞可以釋放溶膠原酶，阻止上皮組織再生與延伸。
6、缺血
近期有人提出肛管後正中線缺血是肛裂好發於該處的原因，因為肛管遠端是由直腸下動脈供應，該血管穿越坐骨直腸窩，分出小支經肛管括約肌至黏膜，但多數後聯合處缺乏直腸下動脈分支(佔85%)。從毛細血管形態學研究也提示後正中線處內括約肌內部的毛細血管較稀疏。有人應用激光多普勒血流儀測得肛管後聯合處的血流較其他象限處為少。以上都説明缺血確是慢性肛裂發病的主要因素。
