pci-e接口的固態硬盤與主板通信使用的是PCI-Express總線，而SATA接口的固態硬盤與主板通信使用的是SATA串行總線，這兩條總線是相互對立的。高端的PCI-E接口固態硬盤由於使用的PCI-E通道數多，甚至可以提供超過SATA3.0接口固態硬盤的速度。
PCI-E接口的固態硬盤和SATA接口的固態硬盤區別主要在於接口不同，通信的總線也不同。對於筆記本電腦而言，PCI-E接口的固態硬盤主要用於多硬盤系統的配置，使用不同於標準SATA的PCI-E插槽；而SATA接口的固態硬盤一般用於替代筆記本內部原配的機械硬盤，以提高磁盤性能。
pci-e是當前主流的總線和接口標準，它原來的名稱為“3GIO”，是由Intel提出的，很明顯Intel的意思是他代表着下一代I/O接口標準。交由PCI-SIG（PCI特殊興趣組織）認證發佈後才改名為“PCI-Express”.這個新標準將全面取代現行的PCI和AGP，最終實現總線標準的統一，也就是説以後的主板接口沒有所謂的顯卡專用接口AGP了，所有接口都是PCI-E接口，不管是網卡還是顯卡。
