如果睾丸痛長期得不到治療會致使男性不育。急性附睾炎是導致睾丸痛的常見原因。慢性附睾炎或者睾丸纖維增生以及睾丸纖維硬化病也可導致睾丸痛。睾丸以及附睾管道出現閉塞以及淋巴細胞浸潤現象都可導致睾丸疼痛。睾丸疼痛也有可能因為前列腺病變導致，所以治療還應考慮前列腺感染。
如果因為泌尿生殖感染導致睾丸疼痛，則彈道消融術可有效治療。這種治療方式採用正負容性電極作用於病變組織，釋放高能超導兆波，穿透組織深部達16cm，使骨盆底部肌肉鬆弛，並改變致病菌賴以生存內環境;使血管通透性增強，藥物更易擴散，促進新陳代謝;同時，激發和調節機體產生主動免疫功能。除了能夠精確定位治療患部外，強大的兆波電流穿過患部，滲透病變組織殺死致病菌，同時由於熱療讓炎症組織的通透性增加，使治療藥物更容易被吸收及代謝，加速疾病治療過程，具有：無創、無痛、定位精確、安全高效的特點。
由於睾丸疼痛科因為睾丸炎引起，治療可選擇光導系統治療。這種利用生物物理的方式達到治療目的非手術療法在治療過程中幾乎不對患者構成損傷和痛。代表了當今醫療水平的發展方向，是泌尿系統感染疾病的高科技領先技術，其對患者的低損傷和微創治療得到世界衞生組織(WHO)的推廣。
輕微睾丸疼痛治療可選擇抗生素以及止痛藥。對於緩解症狀效果明顯，但是不能徹底治癒。病人應卧牀休息，疼痛時採取熱敷止痛。可多做提肛鍛鍊來緩解疼痛以及腫脹現象。如果睾丸疼痛反覆發作，可考慮進行輸精管結或者結紮或者施行睾丸切除術。
