硅膠奶瓶的奶嘴和奶瓶都可以放在開水、微波爐或者消毒鍋裏消毒，硅膠奶瓶能夠耐受200℃的高温，用開水或者消毒鍋消毒10分鐘即可，如果要用微波爐消毒的話，可以將時間設置在3-5分鐘。
1、開水消毒
最方便常見的消毒方法就是把硅膠奶瓶放在開水裏煮沸3-10分鐘，一般每隔3天就要消一次毒，平常使用的時候只需要拿開水燙一圈奶嘴和奶瓶即可。
2、消毒鍋消毒
消毒鍋也是非常適合用來給奶瓶消毒的，自帶烘乾功能的消毒鍋需要消毒1個小時，長時間的高温容易導致奶瓶受損，因此最好選擇紫外線的消毒鍋對奶瓶消毒。
3、微波爐消毒
如果使用微波爐對硅膠奶瓶進行消毒，需要先將瓶內的奶粉清洗乾淨，然後在瓶內裝上清水後，將微波爐設置成高火，微波10分鐘即可，但不能將奶嘴和連接蓋一同放入微波爐消毒。
