在革蘭氏染色中，藍色是由於在細菌表面覆蓋了一層藍色的細菌外膜所形成的。這種藍色的細菌外膜通常由革蘭氏陽性菌（G+菌）產生，而革蘭氏陰性菌（G-菌）則不會產生這種藍色的細菌外膜。
在革蘭氏染色中，如果將細菌塗成革蘭氏陽性菌（G+菌），細菌表面會形成一層藍色的細菌外膜，而如果將細菌塗成革蘭氏陰性菌（G-菌），細菌表面會形成一層紅色的細菌外膜。因此，革蘭氏染色中的藍色通常是指革蘭氏陽性菌的細菌外膜所形成的顏色。
革蘭氏染色（Gram Staining）是用來鑑別細菌的一種方法：這種染色法利用細菌細胞壁上的生物化學性質不同，可將細菌分成兩類，即革蘭氏陽性（Gram Positive）與革蘭氏陰性（Gram Negative）。這一染色方法由丹麥醫生漢斯·克里斯蒂安·革蘭於1884年所發明，最初是用來鑑別肺炎球菌與克雷白氏肺炎菌之間的關係，後推廣為鑑別細菌種類的重要特性之一，對由細菌感染引起的疾病的臨牀診斷及治療有着廣泛用途。
