《加油大魔王！千年之章》是漫畫雙人組合咕啾組創作的長篇漫畫，為《加油大魔王》的重要篇章。該作於2012年3月20日號開始在漫畫雜誌《颯漫畫》三刊連載，於2014年3月25日在《颯漫畫》完結。
該作講述了千年之前人類與魔族的故事，故事結尾迴歸連載現世之章。
故事背景：
宇宙萬物，由唯一的手所著寫。唯一的手創造了無數顆種子，這些種子生長成無數的世界樹。每個世界樹維持着一個世界，每個世界都由一隻“眼”所監視。
有一天，有一隻“眼”發出了抗議。他不想再監視別的世界，他想創造自己的世界。
而唯一的方法，就是讓這個世界毀滅——讓它重新變成一顆種子。擁有這個種子，他就能創造自己的世界。
