1、大小：細菌的大小遠比病毒大，通常細菌的大小以微米來衡量，一般通過普通的光學顯微鏡就可以看到，而且生長條件比較簡單;病毒非常小，大小以納米來衡量。一般需要使用放大倍數的萬倍顯微鏡才可以看到。
2、形態：細菌的外部形態大多為球狀、桿狀、螺旋狀，並且也因此命名為球菌、桿菌以及螺旋菌。而病毒為多面體結構，為了能達到最佳穩定結構，以及最佳比表面積，病毒多位一十二面體。3、構成：細菌是一種單細胞或者多細胞組成的簡單生物，和植物一樣都有細胞壁，因此很多殺菌劑就是破壞其細胞核達到殺菌效果;病毒沒有細胞結構，是最低等的一種生物的結構，一般只含有一種核酸，通過複製和寄生的方式繁殖。
