英國《每日郵報》刊文，指出鞋架上積累的食品碎屑、泥土、灰塵和寵物糞便會播散到房間的地板上，引發交叉感染。動物糞便中的弓形蟲等寄生蟲會在鞋架上存活數天，如果手接觸到它們，再進入嘴裏，嚴重的會致盲。即使鞋子上沒有任何危險的病原體，當你的手接觸到鞋架或無意接觸鞋底時，也會沾染到細菌。另外，櫃式的鞋架，由於長期封閉、黑暗、潮濕、不通風等，更容易使櫃內以及鞋內細菌滋生，從而引起腳氣、腳臭等。
專家建議：在門口放一個腳墊，進門前將鞋子上的灰塵、泥土清理掉再放到鞋架上，有條件的住户，還可以將鞋架放置在門外，放幾雙近期常穿的鞋子;脱鞋之後，應及時把手徹底洗乾淨;定期用半濕的抹布擦一下鞋架，去除灰塵;每週用殺菌液擦洗鞋架，如果是封閉式的鞋櫃，應按先內後外的順序清洗;鞋架內不要放置其他物品，如鞋油、鞋拔子等，避免交叉感染。
國家室內環境質檢中心主任宋廣生説，選鞋架時，最好選擇敞開式、可拆洗的，方便清洗除菌。如果是櫃式的鞋架，買後應勤通風換氣，還可以在裏面適當放些吸附劑，如活性炭、乾燥劑等。選擇木質鞋架時，要注意用料安全，人造木板甲醛含量應符合國家標準。塑料鞋架和木質鞋架不能放在陽光直射的地方，否則容易老化乾裂。如果是安置在陽台等室外區域，建議選擇金屬鞋架，使用壽命更長。木質鞋架受潮易變形，平時要保持乾燥，可以適當用專門的護理劑擦，以保持木頭的光澤。
