精神過度興奮緊張
入睡前玩耍過度，過於激動或疲勞，或受了驚嚇，不安和焦慮，或學習緊張，使其大腦皮層的興奮和抑制過程失去平衡，誘發咀嚼肌的運動發生一時性不規則的痙攣或收縮，產生了夜間磨牙。
腸道寄生蟲病
蛔蟲最喜歡在孩子睡着了以後在腸子裏活動，並且分泌多種毒素。毒素刺激腸道，加快腸道蠕動，引起消化不良，臍周疼痛，睡眠不安；如果毒素刺激神經，致使神經興奮，而致磨牙。同樣蟯蟲也會分泌毒素，並引起肛門瘙癢，影響孩子睡眠併發出磨牙聲音。
消化功能紊亂
比如睡前吃得過飽，大量食物充斥胃腸而刺激了消化道，神經把這些刺激傳到大腦，使管理消化的腦細胞興奮起來，通過反射作用，引起磨牙。
營養不均衡
有些孩子有挑食的習慣，特別是不愛吃蔬菜，形成營養不均衡，導致鈣、磷、各種維生素和微量元素缺乏，引起晚間面部咀嚼肌的不自主收縮，牙齒便來回磨動。
其他
換牙期牙齒髮育不良引起牙齒的咬合障礙，慢性牙周炎，精神運動性癲癇，癔病，或做夢吃東西等均可以造成夜間磨牙。對於磨牙患兒，應儘可能找到病因，然後對症治療。有少數找不到原因，似與遺傳有關。
