可以先把蟲草掰開，如果蟲草內心是發黃或發黑，就説明蟲草已經發生了黴變，已經發黴的蟲草建議不要再食用，不然會對人體有害。蟲草在儲存時要注意防潮、防蛀、防蟲。存放在陰涼乾燥的地方，如果是存放時間需要存很久的話，要在蟲草的存放空間裏放入幾包乾燥劑，這樣就可以保持存放環境的乾燥，起到防黴作用。
最普遍的保存方法則是將冬蟲夏草通過乾燥處理後，放在通風的環境下即可，避免潮濕，也可以防止變質發黴。
另外，冬蟲夏草還可以用密封袋包裝後保存在冷凍櫃裏冷凍即可。如果量比較少，還可以用花椒或者丹皮與冬蟲夏草同放在密閉的玻璃瓶中進行保存，也方便隨取隨用。因為花椒有殺蟲除菌的功效，可以幫助保存。如果受潮，應立即拿出來曬乾。
