內分泌因素在陰莖勃起的調節中起着重要的作用，因此臨牀上許多內分泌疾病都伴有較高的陽痿發生率。除了性腺功能減退等直接影響雄激素水平的疾病外，以下疾病亦常伴發陽痿。
甲狀腺疾病
無論甲狀腺功能亢進還是減退都可以對勃起功能造成不利的影響。對於甲狀腺功能亢進，其血液中的雌激素和雄激素結合球蛋白水平增高，這樣在遊離睾酮減少和雌激素升高的雙重作用下，性功能受到廣泛影響。有報道稱甲狀腺功能亢進患者中性慾低下的發生率為71﹪，陽痿的發生率為56﹪，有的患者甚至可以出現乳房女性化現象。
甲狀腺功能減退者血液中雄激素結合球蛋白降低或正常，但總睾酮的濃度降低，而且睾酮代謝也發生異常，不再轉變為雄甾烯酮，從而影響患者的勃起功能。
高催乳素血癥
由於本病不如糖尿病、甲狀腺功能亢進等疾病常見，故當這樣的患者以陽痿就診時，醫生或患者均可能認為陽痿的發生是由於年齡或心理等因素引起，從而不易作出正確的病因判斷。
通常認為高催乳素血癥導致陽痿的發生是通過對下丘腦-垂體-睾丸軸的影響導致睾酮水平下降所致，但給予睾酮替代治療後其勃起功能似乎不能得到滿意的改善，給予溴隱亭降低催乳素的水平後其勃起功能可以得到迅速糾正，因此本病除了影響下丘腦-垂體-睾丸軸外，可能還存在某種中樞機制。
