1、降低泡發率：乾製的燕窩當中也是存留有水分的，如果放入冰箱冷凍保存，雖然低温能夠避免幹燕窩變質，但其中的水分會因為快速冷凍而硬化，導致整個燕窩硬化度更高，在之後的泡發過程中難以泡發，而且泡發後的體積率還會有所降低。
2、品質下降：幹燕窩經過冷凍後，其中的活性成分也會因低温受到影響，其燕窩表面還會因凍過產生雪花狀，當下次取出降温解凍後，會發現燕窩泡發後不如沒有冷凍的有彈性、晶瑩剔透。
3、影響口感：幹燕窩經過冷凍後，其中的水分、蛋白質、唾液酸等營養成分都會發生一定的影響，就如同長期冷凍過後的肉一樣，再次解凍食用口感會大打折扣。
