一般來説，藥酒最好在進餐時或者餐後喝，以免刺激胃黏膜。而且，因為藥酒多由度數較高的白酒泡製而成，所以不善飲者，如果空腹喝下，很容易上頭，導致心跳加速。 就算是那些平時很能喝酒的，也最好別空腹喝，以防意外。
此外，有些人喜歡在睡前喝點藥酒，自然，一些添加了枸杞、天麻、桂圓等安神中藥的藥酒，的確有助入睡。但這也要因人而異，少數人會因此血液循環加快，變得興奮不已，這就得不償失了。
值得提醒的是，不論出於何種原因喝藥酒，都要適量，否則將嚴重影響身體健康。治療性藥酒服法須遵醫囑，滋補養生類酒的最佳用量以每天1―2兩為宜。同時，有慢性胃炎及胃潰瘍者，肝炎、肝硬化、心功能或腎功能不全者最好別喝。
